Cette section contient des fonds d'archives au sens de « l'ensemble de documents de toutes natures qu'une personne physique ou morale a automatiquement produit ou reçu dans l'exercice de ses activités, rassemblés ou organisés en conséquence de celles-ci, et conservés en vue d'une utilisation éventuelle. » (AFNOR : 1991)
Cette section regroupe des documents uniques ou rares. Des correspondances isolées et des manuscrits y sont notamment rassemblés.
Les fonds contiennent souvent des pièces supplémentaires rassemblées par l'équipe du CIRA dans un but de documentation du fonds, elles sont d'origine et de producteur divers. Il a été décidé de les y conserver pour le moment et signaler la différence de producteur lorsque cela est possible. A l'avenir les compléments d'information seront conservés et traités séparément.
« Un fonds d’archives, résultant de l’application du principe de provenance (ou principe de respect des fonds), est constitué par le regroupement en un ensemble de tous les documents d’archives, conservés par le service et provenant d’un même producteur. Le terme de producteur désigne une personne morale (organisme, organisation), physique (individu) ou une famille, qui, dans le cadre de ses activités, crée et/ou utilise et/ ou rassemble, pour ses besoins propres, des documents. » (Association des archivistes suisses : 2009)

Cet ensemble regroupe des documents très hétérogènes dans leur forme et dans leur valeur. On y trouve autant des pièces uniques manuscrites et des séries de publications de groupes anarchistes peu connus que des publications que l'on trouve dans différentes bibliothèques en Suisse.
Composé principalement d'ephemera (tracts, petites affiches, coupures de presse, etc.) et de petits ensembles de documents récoltés par l'équipe du CIRA, ces pièces isolées ou petits ensembles sont rassemblés à un rythme régulier et selon des pratiques relativement constantes à travers les années, bien que que cette collecte s'effectue en dehors d'une politique d'acquisition déterminée. Il est le produit des apports d'habitué-e-s ou d'ami-e-s de passages qui, soit dans le cadre du fonctionnement courant, soit de retour de voyage, lors de déménagement ou autres amènent ou envoient au CIRA ces documents.
On peut également y trouver des périodiques non conservés par la bibliothèque du CIRA mais contenant des articles concernant des groupes ou activités anarchistes. On peut également y trouver les résultats et la correspondance liées à des recherches effectuées par le CIRA suite à des demandes de renseignements.
Une définition large serait que cet ensemble conserve et ordonne des documents pouvant se classer par pays. Il regroupe toute pièce ou dossier n'entrant pas explicitement dans la politique d'acquisition du CIRA, et/ou dans les catégories habituelles de livres, périodiques, brochures ou affiches (plus grand que A4). Il s'agit parfois de pièces ou de périodiques que le CIRA conserve pour des raisons pratiques pour les besoins de son équipe (ex. "Le journal du GSSA" pour les civilistes).
A noter qu'à certaines périodes les périodiques à parution aléatoires ou uniques étaient classés dans cet ensemble.

Sont rassemblés sous la section C Collections les ensembles qui réunissent des documents d'un même type, le critère de sélection étant ici le support. Le CIRA réserve un traitement spécifique aux documents illustrés en raison de la fréquence des demandes à leur sujet (illustrations pour livres, expositions, etc) et des particularités liés à la conservation de ces supports.
Ce sont des collections au sens de la « réunion artificielle de documents en fonction de critères communs liés à leur contenu ou à leur support et dont la juxtaposition est le fruit de la volonté ou du hasard, par opposition au fonds d'archives constitué de façon organique par un producteur. » (Dictionnaire de terminologie archivistique, Archives de France, 2002).

Il s'agit des documents permettant la gestion quotidienne et long terme du Centre. A ce stade, quelques séries présentent un intérêt particulier car elles peuvent être utilisées comme instrument de recherche orienter ses recherches. Il s'agit de la série publique des bulletins du CIRA (décrites au niveau du sommaire sur le logiciel de bibliothèque PMB et dépouillées en fonction des contenus en lien avec des fonds d'archives spécifiques), de la correspondance du CIRA (qui contient notamment les demandes et résultats de recherches arrivées par écrit au CIRA, ainsi que la série des dossiers produits lors de colloques internationaux auxquels a participé le CIRA.

1. Bulletins du CIRA
2. Correspondance du CIRA
3. Dossiers produits par le CIRA lors de l'organisation ou la participation à des colloques etc.. (ex. Venise 1984, etc..)